Phalaenopsis difformis a fait l'objet de nombreuses descriptions et se décline en une espèce accompagnée de deux varétés ;
           Phalaenopsis difformis
           Phalaenopsis difformis var. difformis
           Phalaenopsis difformis var. kinabaluensis
Les synonymes de Phalaenopsis difformis (Wall. ex Lindl.) Kocyan & Schuit., Phytotaxa 161: 67 (2014) sont au nombre de quatre.
La première description est due à Lindley dans The genera and species of orchidaceous plants : 242 (1833) sous le nom d'Aerides difformis Wall. ex Lindl.
Aerides difforme est ensuite transféré par Schlechter dans le genre Ornithochilus dans Repertorium specierum novarum regni vegetabilis. Beihefte. 4: 277 (1919).

Puis dans le genre Sarcochilus par Tang & F.T.Wang dans Acta Phytotaxonomica Sinica 1: 92 (1951).
 
Phalaenopsis difformis a aussi été classé sous le nom de Trichoglottis diformis (Wall. ex Lindl.) T.B.Nguyen & D.H.Duong in T.B.Nguyen (ed.), Fl. Taynguyen. Enum.: 206 (1984).
 
Phalaenopsis difformis var. difformis a d'abord été cité par lindley dans The genera and species of orchidaceous plants : 242 (1833) dans la description d'Aerides difforme. Le botaniste britannique Henry Fletcher Hance le décrit sous le nom d'Ornithochilus eublepharon dans Journal of Botany 22: 364 (1884).
 
Quelques années plus tard le botaniste français Achille Eugène Finet décrit Ornithochilus delavayi dans Bulletin de la Société Botanique de France 43: 496 (1896).
 
André Guillaumin décrit ensuite Vanda doritoides, également un synonyme, dans Bulletin de la Société Botanique de France 77: 334 (1930).
 
 
Ornithochilus difformis var. kinabaluensis a été décrit conjointement par J.J.Wood, A.L.Lamb & Shim dans Orchids of Borneo 1: 191 (1994). Vingt ans avant d'être transféré dans le genre Phalaenopsis par Kocyan & Schuiteman dans Phytotaxa 161: 67 (2014),
Ci-dessous extraits de la description dans Orchids of Bornéo.
 
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