Segments jaunes à jaune verdâtre, avec de larges taches d'un brun plus ou moins foncé. Labelle jaune avec une ou deux stries longitudinales brun clair de part et d'autre de la carène centrale. Floraison estivale.
Très similaire au Phalaenopsis fuscata. Seuls quelques détails du labelle difficiles à apprécier et la longueur de la colonne permettent de distinguer ses deux espèces que plusieurs botanistes considèrent comme une seule et même espèce.
La carène charnue située à la partie inférieure de la colonne sous la cavité stigmatique aboutit à cette cavité stigmatique chez Phalaenopsis kunstleri alors qu'elle disparaît avant cette cavité chez Phalaenopsis fuscata.
Le cal bifide situé le plus en arrière montre une rainure bien nette et les deux parties de ce cal restent parallèles chez Phalaenopsis kunstleri alors que chez Phalaenopsis fuscata les extrémités de ce cal bifide sont très nettement divergentes.
Le lobe médian du labelle est nettement arrondi chez Phalaenopsis kunstleri et la partie postérieure de la carène médiane est plus proéminente.

On peut aussi remarquer que les lieux de collecte de Phalaenopsis kunstleri sont distants de 2 000 kilomètres et qu'aucune plante n'a été trouvée entre les deux. Les climats sont très différents. La région birmane dispose plutôt d'un climat frais et d'hivers secs, alors que l'on note peu de variations saisonnières en Malaisie, avec une température plus élevée et des pluies abondantes toute l'année. Cependant, la ville de Malaisie qui sert de référence pour la collecte de ces plantes (Ipoh, capitale de l'état de Perak) est néanmoins entourés sur trois côtés de montagnes culminant à plus de 1800 mètres, ce qui laisse à penser que cette espèce est plutôt d'altitude et qu'elle préfère des températures un peu plus fraîches que les autres phalaenopsis.
Les vrais Phalaenopsis kunstleri sont rares en culture et une grande confusion existe du côtè des étiquettes avec Phalaenopsis fuscata.